为什么相同分子量的线状、开环和超螺旋DNA在琼脂糖凝胶中移动速度是不一样?为什么超螺旋DNA移动最快,而线状双链DNA移动最慢?

Question

为什么相同分子量的线状、开环和超螺旋DNA在琼脂糖凝胶中移动速度是不一样?
为什么超螺旋DNA移动最快,而线状双链DNA移动最慢?

Answer 1

"Supercoiled" (or "Covalently Closed-Circular") DNA is fully intact with both strands uncut, and with a twist built in, resulting in a compact form, so they move faster others.

"Linear" DNA has free ends, it moves at the speed similar to its molecular weight, compared to the markers.

"Nicked Open-Circular" DNA has one strand cut, it is not supercoiled, and it is not compact form, but it is circular. Therefore, it migrates slower than the above 2 forms. 

please see the picture.