如何判断获得的某一真核生物cDNA序列是否为全长序列不要告诉我blast哦 主要弄清楚真核生物mRNA序列的基本特征

Question

如何判断获得的某一真核生物cDNA序列是否为全长序列
不要告诉我blast哦 主要弄清楚真核生物mRNA序列的基本特征

Answer 1

真核生物 mRNA一般由5’端帽子结构、5’端不翻译区、翻译区（编码区）、3’端不翻译区和3’端聚腺苷酸尾巴构成.
分子中除 G构成帽子外,常含有其他修饰核苷酸,如 A等
5’端帽子结构通常有3种类型,即： G（5’）ppp(5’)N； G(5’)ppp(5’) N和 G(5’)ppp（5’） N.一般认为帽子的功能与翻译的启动有关许多真核生物 mRNA(如珠蛋白mRNA)除去帽子后翻译效率大大降低.5’端不翻译区,也叫前导顺序不同的真核mRNA的前导顺序长度不同,有的只有10个核苷酸,有的则有200个核苷酸.与原核mRNA相似,真核mRNA5’端不翻译区中常有一段顺序与核糖体小亚基上的18SrRNA的3’端的一段顺序互补并结合,这种结合与真核mRNA的翻译启动有关.
通常要经过测序后,确定了帽子结构和POLY A的尾巴在同一序列上
才能认为获得了cDNA的全长