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关于DNA序列在NCBI上比对的问题1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?2.请大概说一下,我想知道是什么菌,
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关于DNA序列在NCBI上比对的问题
1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?
2.请大概说一下,我想知道是什么菌,应该怎样使用NCBI,越详细越好.
1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?
2.请大概说一下,我想知道是什么菌,应该怎样使用NCBI,越详细越好.
▼优质解答
答案和解析
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.
把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看这些完全配对的序列出自什么菌种（不能有两个菌种的序列和你的序列相同,如果相同,那么就不能作为鉴定菌种的特征序列了）,并且查阅提交这个序列的相关文献.得到进一步的信息.
我说的步骤,只要你认真看NCBI的网页,你自己应该是可以操作下去的.
把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看这些完全配对的序列出自什么菌种（不能有两个菌种的序列和你的序列相同,如果相同,那么就不能作为鉴定菌种的特征序列了）,并且查阅提交这个序列的相关文献.得到进一步的信息.
我说的步骤,只要你认真看NCBI的网页,你自己应该是可以操作下去的.
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