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我的测序结果存在这样的polyT结构,我想以此位点设计引物,请问可行吗?GAATGCCTTTTTTGTTTTTTT,以此序列设计反向互补引物AAAAAAACAAAAAAGGCATTC.这样行吗,计算出来的ΔG太低了（23.8）,这样测序能成功吗?
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我的测序结果存在这样的polyT结构,我想以此位点设计引物,请问可行吗?
GAATGCCTTTTTTGTTTTTTT,以此序列设计反向互补引物AAAAAAACAAAAAAGGCATTC.这样行吗,计算出来的ΔG太低了（23.8）,这样测序能成功吗?请高手指教,不慎感激.
GAATGCCTTTTTTGTTTTTTT,以此序列设计反向互补引物AAAAAAACAAAAAAGGCATTC.这样行吗,计算出来的ΔG太低了（23.8）,这样测序能成功吗?请高手指教,不慎感激.
▼优质解答
答案和解析
我一般不会选用这种引物测序,如果是要避开POLY结构可以采取双向测序.
不过,就你列举的这个序列直接测,应该不会受太大影响,根据我的经验像这种被隔开的POLY不容易影响测序结果,只有在连续的POLY大于8个碱基时才会影响测序.
不过,就你列举的这个序列直接测,应该不会受太大影响,根据我的经验像这种被隔开的POLY不容易影响测序结果,只有在连续的POLY大于8个碱基时才会影响测序.
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