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设计RT-PCR的引物时,经常说要跨外显子的接头区,意思是不是就是说上下游引物要落在两外显子的中间部分?
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设计RT-PCR的引物时,经常说要跨外显子的接头区,意思是不是就是说上下游引物要落在两外显子的中间部分?
▼优质解答
答案和解析
非也.在跨外显子接头区的情况下,谓语是“跨”,主语不是”引物“而是”扩增子“.上下游引物落在外显子的哪部分其实有很多可能.楼主从扩增子的角度来理解比较容易:
1.外显子的接头区,相信楼主已经理解.说细了就是两个相邻碱基,一个属前一个外显子,一个属后一个外显子.
2.扩增子序列包含如上这两个碱基,则满足“跨外显子接头区”.
3.技术上来说只跨过去一个碱基还嫌少了点,因为一个碱基不同的情况下,仍能够有扩增反应,即是说特异性不够.但理论上来说以上两点就说清楚了.
明白?
1.外显子的接头区,相信楼主已经理解.说细了就是两个相邻碱基,一个属前一个外显子,一个属后一个外显子.
2.扩增子序列包含如上这两个碱基,则满足“跨外显子接头区”.
3.技术上来说只跨过去一个碱基还嫌少了点,因为一个碱基不同的情况下,仍能够有扩增反应,即是说特异性不够.但理论上来说以上两点就说清楚了.
明白?
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