做过DNA,基因,序列分析之类的请进!第一,都需要分析什么内容,方法是什么?我目前知道的有blast同源序列.但是听别人说还要找什么开放阅读框,外显子的,怎么找啊.具体点哈!网站上有的颜色不知

Question

做过DNA,基因,序列分析之类的请进!
第一,都需要分析什么内容,方法是什么?我目前知道的有blast同源序列.但是听别人说还要找什么开放阅读框,外显子的,怎么找啊.具体点哈!网站上有的颜色不知道表示什么含义,郁闷.第二,还有什么需要分析的?第三,我还知道好像要设计引物什么的,我的序列已经已知了啊.第四,整个流程该是怎样的,有范例么?要从得到序列之后的,不要如何得到序列的方法的（比如双脱氧云云）.最好留下Q请教,本人初涉分子,有好的参考书籍也欢迎推荐.感激不尽.

Answer 1

第一,都需要分析什么内容,方法是什么?
分析的内容很多,看有无突变,编码区的序列编码什么蛋白,非编码区的可能调控机制等等.有了序列才可以做下一步的工作.
我目前知道的有blast同源序列.但是听别人说还要找什么开放阅读框,外显子的,怎么找啊.具体点哈!网站上有的颜色不知道表示什么含义,郁闷.
UCSC genome browser （http://genome.ucsc.edu/ ）是一个很好的看外显子的网站,外显子都用黑色的块表示.
第二,还有什么需要分析的?
太多了,看你需要干什么.比如要克隆,链接等,就要看有无限制性酶切位点等等.
第三,我还知道好像要设计引物什么的,干嘛用的啊?我的序列已经已知了啊.
引物是做PCR,或者继续测序用的.
第四,整个流程该是怎样的,有范例么?要从得到序列之后的,不要如何得到序列的方法的（比如双脱氧云云）.最好留下Q请教,本人,有好的参考书籍也欢迎推荐.感激不尽.
《分子克隆》是一本很好的入门书,不过既然初涉分子,一切还是慢慢来,问题要一个一个问,这样才能懂.最好是实验时遇到了问题,再来问我,这样就一个例子来教你,效果比较好. 如果你是研究生水平,那最好.本科也没有问题.